长链非编码RNA FEZF1-AS1在癌症患者中的作用:荟萃分析
刘辉1 梁超杰 张永欣 熊永强 陈浩 严晨强 黄河#
本文包括6个图表和2个表格。
摘要:
背景和目的:已经证明长链非编码RNA FEZF1-AS1在各种癌症中过表达,并且可能是癌症患者的潜在生物标志物。然而,许多研究受样本量和争议结果的限制。因此,我们进行了一项荟萃分析,以评估FEZF1-AS1在癌症患者中的临床病理和预后价值。
方法:使用PubMed,Cochrane图书馆,Web of Science,EMBASE数据库,中国CNKI和中国万方数据库鉴定符合条件的研究。 计算具有95%置信区间(CI)的汇总比值比(OR)和风险比(HR)以评估FEZF1-AS1与癌症患者的临床病理学特征和预后之间的相关性。
结果:该荟萃分析纳入13项研究,共纳入1237例患者,汇总结果显示FEZF1-AS1的高表达与较大的肿瘤大小(大与小:OR = 1.86,95%CI = 1.08-3.20, P = 0.03)、分化程度较低(低与高+中度:OR = 2.02,95%CI = 1.18-3.45,P = 0.014)、淋巴结转移增加(是与否:OR = 3.44,95%CI = 2.16- 5.49,P <0.001)和晚期TNM分期(I + II对III + IV:OR = 0.31,95%CI = 0.23-0.41,P <0.001)有关,但与性别(男性与女性:OR = 0.04),95%CI = 0.03-0.11,P = 0.25)、年龄(> 60 vs <60:OR = 1.31,95%CI = 1.02-1.67,P = 0.37)无关。计算出的HRS证明FEZF1-AS1与差的OS(高与低:HR = 1.56,95%CI = 1.18-2.06,p =0.002)和差的DFS(高与低:HR = 1.42,95%CI = 1.01-2.00,p =0.04)有关。
结论:FEZF1-AS1的过度表达与较大的肿瘤大小,较低的分化,增加的淋巴结转移和晚期TNM分期有关,FEZF1-AS1可能是预测癌症患者预后的潜在生物标志物。
关键词:长链非编码RNA FEZF1-AS1,肿瘤,预后,荟萃分析
Background and Aim: Long non-coding RNA FEZF1-AS1 has been demonstrated to be overexpressed in various cancers and may be a potential biomarker for cancer patients. However,many studies are limited by sample sizes and controversial outcomes. So we conducted a meta-analysis to evaluate the clinocopathological and prognostic value of FEZF1-AS1 in cancer patients.
Methods: Eligible studies were identified using PubMed, Cochrane Library, Web of Science, EMBASE database, Chinese CNKI, and Chinese WanFang database. Pooled odds ratios (ORs) and hazard ratios (HRs) with 95% confidence interval (CI) were calculated to assess the correlation between FEZF1-AS1 and the clinicopathological features and prognosis in cancer patients.
Results: Fourteen studies with 1237 patients were included in this meta-analysis, the pooled results indicated that the high expression of FEZF1-AS1 was related to larger tumor size(large vs small: OR=1.86, 95%CI=1.08-3.20, P=0.03), lower differentiation(Low vs High+moderate: OR=2.02, 95%CI=1.18-3.45, P=0.014), increased lymph node metastasis(Yes vs No: OR=3.44, 95%CI=2.16-5.49, P<0.001) and advanced TNM stage(I+II vs III+IV: OR=0.31, 95%CI=0.23-0.41, P<0.001), but was not related to gender (male vs female: OR=0.04, 95%CI=0.03-0.11, P=0.25), age (>60 vs <60: OR=1.31, 95%CI=1.02-1.67, P=0.37). And pooled HRs demonstrated that FEZF1-AS1 was correlated with a poor OS (high vs. low: HR=1.56, 95% CI= 1.18-2.06, p=0.002) and a poor DFS (high vs. low: HR=1.42, 95% CI= 1.01-2.0, p=0.04)。
Conclusion: Over-expression of FEZF1-AS1 was associated to larger tumor size, lower differentiation, increased lymph node metastasis and advanced TNM stage, and FEZF1-AS1 may be a potential biomarker to predict the prognosis for cancer patients.
Keywords: Long non-coding RNA FEZF1-AS1, neoplasm, prognosis, meta-analysis
介绍
癌症是危害人类健康的主要因素之一,近年来其发病率仍在上升[1-3]。虽然随着医学技术的发展,癌症的治疗有了很大的改善,但癌症的预后仍不容乐观[4]。其主要原因是对肿瘤发病机制的认识不清楚,缺乏特异性生物标志物用于癌症患者的早期诊断和预后预测因素[5]。因此,找到癌症诊断和预后的具体指标是一个迫切的问题。
长链非编码RNA(lncRNA)大于200nt,是一种大分子ncRNA,可在多种生物过程中发挥调节作用[6]。它们分布广泛,并且由于缺乏有效的开放阅读框而无法编码蛋白质[7,8]。作为哺乳动物转录组的重要组成部分,lncRNA的功能还有待进一步研究。最初,lncRNA被认为是RNA聚合酶II转录的副产物或基因组转录的噪声,并且没有生物学功能[9]。然而,最近的研究表明,lncRNA在细胞的正常生理活动中起着至关重要的作用,并参与许多癌症和其他疾病的发展[10]。LncRNA不仅参与核转运,转录调控,蛋白质降解,基因组印记,染色质重塑和X染色体沉默[11-13],还参与乳腺癌[14],前列腺癌[15],非小细胞肺癌[16],胃癌[17],肝细胞癌[18],卵巢癌[35],鼻咽癌[36]等等癌症的进展。
长期非编码RNA前脑胚胎锌指蛋白1反义RNA 1(FEZF1-AS1),位于7q31.32,已被证实在胃癌等各种肿瘤[19],结直肠癌[20],胰腺癌[21] 中过表达等等。此外,研究表明FEZF1-AS1的表达与临床病理特征和预后有关,然而,许多研究的样本量较小且有争议的结果。Chen等人[20] 首先发现FEZF1-AS1在结直肠癌(CRC)中过表达,提示FEZF1-AS1的表达与肿瘤大小,淋巴结转移和转移有关,而与性别,年龄,肿瘤大小和肿瘤分化程度无关,FEZF1-AS1表达增加表明总生存率(OS)和无病生存率(DFS)较差。接下来,He等人[22] 报道FEZF1-AS1在非小细胞肺癌(NSCLC)中高表达,FEZF1-AS1的表达与淋巴结转移,分化和TNM分期有关,而与性别和年龄无关。Jin等人[23] 表明FEZF1-AS1在肺腺癌(LAD)组织中增加,FEZF1-AS1表达与肿瘤大小,TNM分期和淋巴结转移相关,而与性别,年龄和分化程度无关。Liu等人[19] 表明FEZF1-AS1与TNM分期,肿瘤大小有关,但与胃癌(GC)的性别,年龄和分化程度无关,FEZF1-AS1的高表达与较短的DFS有关。Zhou等人[24] 发现FEZF1-AS1在骨肉瘤(OS)样本中与正常组织相比上调,FEZF1-AS1的表达与肿瘤大小,转移和TNM分期呈正相关,高FEZF1-AS1表达预示OS差。鉴于上述样本量小的差异和局限性,目前还没有FEZF1-AS1在癌症中作用的荟萃分析,因此我们进行了这项荟萃分析,以回顾FEZF1-AS1在癌症患者临床病理和中预后中的价值。
1.资料和方法:
1.1.搜索策略
在数据库中进行了详尽的文献检索,包括PubMed,Cochrane图书馆,Web of Science,EMBASE,中国CNKI和中国万方数据库。搜索于2018年12月01日结束。使用了以下关键词:“FEZF1-AS1”或“长链非编码RNA FEZF1-AS1”或“长链非编码RNA前脑胚胎锌指蛋白1反义RNA 1”和“癌症”或“肿瘤”。
文献纳入标准是:(1)病例可获得种族和病例完整信息;(2)患者明确诊断为癌症;(3)癌组织及癌旁组织中FEZF1-AS1表达有差异;(4)组织或血清中通过qRT-PCR或ISH法检测FEZF1-AS1的表达;(5)结果包括临床病理学特征,总生存率和无病生存率和危害比(HRs),或者可以从公布的数据中计算出来。
文献排除标准:(1)动物试验,病例报告,评论,信件,会议摘要和生态学研究。(2)基于相同数据库或患者的重复研究。(3)缺乏FEZF1-AS1表达与患者预后的生存资料数据。
1.2.文献质量评价
作者(刘辉,梁超杰)根据标准独立搜索文章。对标题和摘要进行了可能符合条件的研究。通过讨论,重新提取或第三方裁决解决差异。提取的数据包括第一作者,出版年份,实验方法,临床病理学特征和HRs,总生存率和无病生存率为95%CI。通过纽卡斯尔-渥太华量表(NOS)评估研究质量,当NOS ≥ 6时,我们认为该研究是高质量的,否则被认为是低质量的。这项荟萃分析中包含的所有研究都被认为是高质量的。文献的质量评估由两位研究者完成。
1.3文献资料提取
作者(刘辉,梁超杰)对于纳入的文章进行资料评估录入。(1)基础信息,包括题名,作者,发表时间。(2)对于需要从文献中提取的数据包括样本例数、年龄、性别、肿瘤病理特征、总体生存率及无病生存率,录入统计学表格。
1.4公共数据和工具
本研究符合TCGA(http://cancergenome.nih.gov/publications/publicaTionguide
lines)提供的出版指南.TCGA数据门户(https://gdc-portal.nci.nih.gov)和UCSC Xena项目(https://xena.ucsc.edu)用于提取RNAseqV2和临床数据。
1.5统计学方法
在该荟萃分析中,通过Review Manager 5.3软件计算合并比值比(OR)和具有95%置信区间(CI)的HR。本文中Kaplan-Meier曲线的生存数据由Engauge Digitizer 10.0软件提取。FEZF1-AS1与临床病理特征(性别(男性与女性),年龄(较大与较小),肿瘤大小(较大与较小),分化(低与高+中),淋巴结转移(是与否),当I2> 50%或<50%时,TNM分期(I + II对III + IV)),OS和DFS被评估为固定或随机效应模型。如果95%CI不重叠,则认为HR或OR具有统计学意义。通过漏斗图检查潜在的发表偏倚.
2. 结果
2.1纳入文献的基本情况
选择过程如图1所示,按照纳入及排除标准,[19-24, 26-32 34-36] (1例非小细胞肺癌(NSCLC),2例结直肠癌(CRC),3例胃癌(GC),2例肺腺癌(LAD),1例胰腺导管腺癌(PADC),1例骨肉瘤(OS),1例肝细胞癌(HCC),1例宫颈癌(CC),1例乳腺癌(BC),1例卵巢癌,1例鼻咽癌),最终有1237名患者被纳入本荟萃分析。纳入的研究发表于2017年至2018年,所有研究均来自中国,样本量范围为39至196名患者,11篇文章以英文发表,2篇以中文发表。 根据NOS标准,所有研究得分≥6,表明所有文章都是高质量的。临床病理学特征和存活信息总结在表1中。
2.2 FEZF1-AS1表达与癌症患者临床病理特征的关系
如表2所示,在该荟萃分析中计算了FEZF1-AS1表达与癌症患者的临床病理学特征之间的关系。FEZF1-AS1的表达与性别之间的关联包括9篇文章,其中包括885名患者,汇总结果表明FEZF1-AS1表达与性别无关(男性与女性:OR = 0.04,95%CI = 0.03-0.11),P = 0.25,图A)。来自11项研究和1107名患者的汇总结果表明FEZF1-AS1的表达与年龄无关(年龄与年龄相比:OR = 1.31,95%CI = 1.02-1.67,P = 0.37,图B)。汇总的结果表明,FEZF1-AS1与较大的肿瘤相关(大与小:OR = 1.86,95%CI = 1.08-3.20,P = 0.03,图C)和较低的分化(低与高+中度:OR = 2.02,95%CI = 1.18-3.45,P = 0.014,图D)。另外,对358名患者进行的5项研究表明,FEZF1-AS1的表达与淋巴结转移增加有关(Yes vs No:OR = 3.44,95%CI = 2.16-5.49,P <0.001,图E),同样,10项研究包括1033名患者表明FEZF1-AS1表达与晚期TNM分期有关(I + II对III + IV:OR = 0.31,95%CI = 0.23-0.41,P <0.001,图4F)。
2.3 FEZF1-AS1表达与癌症患者总体生存的关系
计算了11项研究的总生存率HR,其中包括1117名患者,汇总的HRs表明FEZF1-AS1的高表达与总体生存率差有关(高与低:HR = 1.56,95%CI = 1.18 -2.06,p =0.002,图G)。对于癌症类型行亚组分析,不同肿瘤类型的总体生存率,如图I,结果显示:FEZF1-AS1表达的增高和消化系统癌症预后差(HR = 1.66,95%CI = 1.19-2.31,p =0.003)有关、而呼吸系统癌症(HR = 1.91,95%CI = 0.82-4.42,p =0.13)因纳入研究过少,结果存在异质性。
2.4 FEZF1-AS1表达与癌症患者无病生存的关系
通过4项研究和393名患者计算无病生存率(DFS)的HR,汇总研究表明FEZF1-AS1的高表达与不良DFS相关(高与低:HR = 1.42,95%CI = 1.01-2.00,p =0.04,图H)。
2.5 发表偏倚和敏感性分析
根据图A、B、C、D、E、F结果,性别(P=0.91),年龄(P=0.87),淋巴结转移(P=0.38),TNM分期(P=0.69),总体生存率(P=0.34),无病生存率(P=0.56)没有发表偏倚,然而,肿瘤尺寸(P=0.006),肿瘤分化(P=0.002)存在发表偏倚,因此行敏感性分析,来探讨个别研究是否影响了合并OR,并没有发现其中研究对于合并的OR值有实质性影响,这表明需要有更多的研究来进行下一步的分析。
3.结论
过去的十几年,人类基因层面与恶性肿瘤发生的相关性成为研究热点。最近,越来越多的证据表明lncRNA参与了癌症的进展和发展[33]和lncRNA可能是癌症治疗的潜在分子靶点[34]这些热的lncRNA之一是癌症相关的FEZF1-AS1,癌症进展与FEZF1-AS1之间的分子机制在几项研究中进行。
本荟萃包括13篇文章,有1237名患者被纳入本荟萃分析。纳入的研究发表于2017年至2018年,所有研究均来自中国,样本量范围为39至196名患者,11篇文章以英文发表,2篇以中文发表。 结果发现FEZF1-AS1FEZF1-AS1的表达与肿瘤大,分化程度低,淋巴结转移和晚期转移有关,但与性别,年龄无关。 此外,汇总的HRs显示FEZF1-AS1的表达与较差的OS和DFS相关,并且FEZF1-AS1的表达可能是癌症患者的独立预后作用。
胃癌(GC)中,Liu等人 [19] 表明FEZF1-AS1的下调在体内和体外均显着抑制细胞增殖,并通过引起G1期阻滞和S期减少来抑制细胞周期进程。 此外,FE21F1-AS1下调P21表达,RNA-pull-down测定显示FEZF1-AS1可与LSD1结合,因此FEZF1-AS1可通过募集LSD1抑制p21转录,从而导致H3K4me2去甲基化。同样,Wu等人[27] 报道FEZF1-AS1表达的减少可通过抑制Wnt /βcatenin信号通路抑制胃癌(GC)细胞的增殖和集落形成,抑制细胞周期。
结直肠癌(CRC)中,Chen等人 [20] 表明FEZF1-AS1在体外促进结直肠癌(CRC)细胞增殖和集落形成,促进体外结直肠癌(CRC)细胞的迁移和侵袭,FEZF1-AS1的减低诱导G1期阻滞,但不引起细胞凋亡,抑制裸鼠肿瘤生长和转移,FEZF1是结直肠癌(CRC)中的致癌基因。而Bian等人[31] 结果显示,FEZF1-AS1可通过结合和增加丙酮酸激酶2(PKM2)蛋白的稳定性来促进CRC细胞的增殖和转移,增加的PKM2可进一步激活STAT3信号。
胰腺导管细胞癌(PDAC),Ye等人 [21] 报道FEZF1-AS1可通过直接结合miR-107作为竞争性内源RNA,ZNF312B是miR-107的靶基因,FEZF1-AS1的下调显着抑制PDAC的增殖,集落形成,迁移和侵袭体外通过FEZF1-AS1 / miR-107 / ZNF312B轴细胞,FEZF1-AS1的下调抑制小鼠异种移植物的肿瘤生长。
肝细胞癌(LIHC)中,Wang等[31] 发现FEZF1-AS1的敲低可通过抑制JAK2 / STAT3信号介导的上皮 - 间充质转化(EMT)来抑制肝细胞癌(HCC)细胞的肿瘤生长,迁移和侵袭。在NSCLC中,He等人[22] 表明FEZF1-AS1的下调通过上调E-钙粘蛋白和ZO-1水平抑制上皮 - 间质转化(EMT)过程,这也表明FEZF1-AS1的减少抑制了Wnt /β-catenin信号通路。
肺腺癌(LAD)中,Jin等 [23] 发现FEZF1-AS1促进肺腺癌(LAD)细胞增殖,RNA免疫沉淀和RNA下调分析显示FEZF1-AS1可直接与EZH2和LSD1结合,因此FEZF1-AS1可将EZH2和LSD1募集到p57促进区,从而促进肺腺癌(LAD)进展。因此,Liu等人 [28] 研究结果显示,FEZF1-AS1通过调节FEZF1的表达促进了肺腺癌的进展。
骨肉瘤(OS)中,周等人 [24] 研究表明FEZF1-AS1可通过FEZF1-AS1 - miR-4443 - NUPR1轴促进骨肉瘤细胞的增殖,迁移和侵袭,预示着这可能是骨肉瘤治疗的新靶点。
卵巢癌(Ovarian Cancer)中,Xia zhao等人[36]研究表明FEZF1-AS1机械性调控JAKC-STAT3的信号通路的表达和激活,促进细胞增殖,抑制卵巢癌的进展。
鼻咽癌(NPC)中,Cheng Y [36]研究表明InRNA FEZF1-AS1 通过诱导EMT和激活-catenin信号通路,增强鼻咽癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。
这些文章一致表明,FEZF1-AS1可能是癌症进展和发展的关键调节因子。 然而,大多数研究受样本量和争议结果的限制,因此我们进行了这项荟萃分析,以检查FEZF1-AS1在各种癌症中的临床病理和预后价值。
据我们所知,这项研究是第一个探索FEZF1-AS1在癌症患者中的作用的荟萃分析,但是,应该强调一些局限性,首先,本荟萃分析中包括的患者数量和肿瘤类型是有限的,这可能会削弱我们的结论的可靠性,因此应该包括更多的样本量和各种癌症的研究,以支持结果。 其次,关于FEZF1-AS1与临床病理特征之间关系的荟萃分析的异质性是显著的,这可能是由于样本量和肿瘤类型有限造成的。第三:一些未发表文章可能造成发表偏倚。
尽管存在上述局限性,本荟萃分析得出结论:FEZF1-AS1的高表达与淋巴结转移增加和晚期TNM分期有关,而FEZF1-AS1与OS和DFS较差有关,表明FEZF1-AS1可能作为中国癌症患者的潜在预后生物标志物,然而,需要更多的样本量和各种肿瘤类型的研究来验证和加强FEZF1-AS1在癌症患者中的临床病理学和预后价值。
致谢
资金来源:无
利益冲突
作者报告:这项工作没有利益冲突。
图解
图1.研究选择的流程图。
图2.评估FEZF1-AS1表达与临床病理特征之间关系的研究的森林图和Begg的发表偏倚图。 A.性别 B.年龄;
图3.评估FEZF1-AS1表达与临床病理特征之间关系的研究的森林图和Begg的发表偏倚图。 C.肿瘤大小 D.分化;
图4.评估FEZF1-AS1表达与临床病理特征之间关系的研究的森林图和Begg的发表偏倚图。 E.淋巴结转移 F. TNM分期。
图5.评估FEZF1-AS1表达与总生存(OS)率(A),无病生存率(DFS)率(B)关系的研究的森林图和Begg的发表偏倚图
图6.评估FEZF1-AS1表达与消化系统疾病、呼吸系统疾病的关系的亚组研究。
表1 各研究特点
表2 FEZF1-AS1与临床病理特征之间的关系
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