橙皮素电场作用的分子结构和红外光谱精细分析
王新强, 葛浩然
, 李桂琴
, 叶松
, 汪杰君
, 甘永莹
, 王方原
摘 要 橙皮素(HES)是一种二氢黄酮药物,为研究在外电场(EEF)作用下,HES的分子结构和光谱的变化,本文利用密度泛函理论(DFTY)以及6-311G(d,p)基组,在外电场(-0.005~0.010a.u.)作用下优化HES分子的基态几何构型,研究了分子总能量、红外光谱( IRS)、偶极矩(DM)和能隙。在此基础上,采用含时密度泛函理论(TDDFT),研究不同EEF下对紫外可见吸收光谱(UV-Vis-S)、激发态(ES)的影响。结果显示,随着EEF的增强,分子总能量先升后降,DM则先降后增,键长和振子强度(OS)的变化复杂。正负EEF都增强时,能隙不断减小,IRS吸收峰(AP)和UV-Vis-S的2个AP均出现了频谱移动 ,分子各个激发态能量(EE)呈现减小趋势。分析外电场下物质的分子结构和光谱,将为研究橙皮素的药效对其进行电场解离提供理论参考。
关键词: 橙皮素(HES); 外电场(EEF); 分子结构; 光谱
引 言
橙皮素(hesperetin, HES)是二氢黄酮中的一种关键性药物,具有健胃、利尿、抗动脉粥硬化、调节心血管功能、抗病毒、保护视力、保护神经系统以及提高其他药物生物利用度的疗效,广泛应用于医学的各个领域。HES还是
-淀粉酶抑制剂
,能有效的缓解糖尿病。另外HES还有抑制癌细胞的扩大、转移以及抗肿瘤的作用
。近年来,人们主要研究了HES的抗氧化和抑制癌细胞的功效,例如探究HES抗氧化活性
,抵制致癌基因表达
,但是对橙皮素在外电场(external electric field, EEF)下的分子结构、红外光谱(infrared pectroscopy, IRS)及紫外可见吸收光谱(UV-visible absorption spectrum,UV-Vis-S)的研究很少有报道。EEF会对分子特性产生一定的影响,改变其电子光谱、分子取向甚至产生新的化学键
。研究EEF下HES分子特性,可以为电场解离方法研究其抗氧化和抗菌抗癌的功效提供理论指导。本文首先选用密度泛函理论(density function theory, DFTY),分析了EEF作用下HES分子的键长、偶极矩(dipole moment,DM)和IRS的吸收峰(absorption peak,AP)的蓝移(blue shift,BS)和红移(red shift,RS)。接着通过TDDFT
方
法进行仿真得到不同EEF下激发态(excited state,ES)的激发能(excitation energy,EE)和振子强度(oscillator strength,OS),图1为其未优化的分子结构图。
图1 未优化的HES分子结构图
Fig. 1 Unoptimized molecular structure of HES
1 理论和计算方法
考虑EEF的作用,分子体系由两块组成
(1)
其中,是无EEF的哈密顿量,
为EEF与分子体系的相互作用
。考虑
, EEF与分子体系的相互作用能为
(2)
其中是分子电偶极矩, F为外电场。
本文利用软件,首先选用DFTY/ B3LYP/6-311G(d, p)方法,沿X轴方向施加EEF(-0.005~0.010a.u.)。接着分析了不同EEF下HES分子的基态几何参数和IRS的改变情况。最后通过
方法,在相同的基组下,仿真HES分子,得到前9个单重ES的EE和OS,并分析其在不同EEF下的变化情况。
无EEF作用时对HES分子优化后的基态结构如图2所示。对比图1图2,可以发现图2中C1与O18间的单键、C2与C26间的单键都优化成了双键,转变为烯醇式结构,这样促使分子中更多的基团与苯环处于同一个平面,构成一个共轭体系,使分子能量降到最低,形成最稳定的结构。
图2 无EEF作用的HES分子优化结构图
Fig. 2 Optimized molecular structure of HES without EEF
2 结果与讨论
2.1 不同EEF下HES分子的几何结构
采用DFTY/B3LYP/6-311G(d, p)方法,在EEF(-0.005~0.010a.u.)作用下进行优化,得到HES的基态稳定结构的主要参数,见表1和表2。
从表1可以看出,在EEF作用下, HES的基态总能量在负向EEF(-0.005~0a.u.)下不断增大,而在正向EEF(0~0.005a.u.)上升(上升0.00615a.u.),在EEF(0.005~0.01a.u.)下逐步衰减(衰减0.00248a.u.,斜率变小),如图3所示。DM的改变则恰恰相反,在EEF(-0.005~0a.u.)一直减小,而在正向EEF(0~0.01a.u.)先降低后升高,在F=0.005a.u., DM达到极小值为4.8791。如图4所示。
表2列出了部分键长在不同EEF下的大小,从图5可以看出,在EEF(-0.005~0.010a.u.)作用下, R(1,2)的键长不断伸长,而R(1,18), R(2,26), R(21,30), R(34,35)的键长明显缩短; R(13,14)的键长在负向EEF(-0.0050~0a.u.)作用下缓慢缩短,而在正向EEF(0~0.01a.u.)下逐渐被拉长,变化并不强烈(标准差为0.00075Å);另外R(20,24), R(25,26)也有小幅缩短的现象,变化也不强烈(标准差分别为0.00121Å,0.00164Å)。
图3 分子在EEF作用下的基态总能量变化
Fig. 3 Ground state energy of HES under different EEF
图4 分子在EEF作用下的偶极矩变化
Fig. 4 Dipole moment of HES under different EEF
图5 分子部分键长随EEF变化的关系
(a) R(1,2),R(2,26),R(1,18),R(34,35);
(b)R(13,14),R(21,30),R(20,24),R(25,26)
Fig. 5 Partial results of several bond lengths under different EEF
(a)R(1,2),R(2,26),R(1,18),R(34,35); (b)R(13,14),R(21,30),R(20,24),R(25,26)
分子内电场与EEF的叠加作用,能定性的分析键长的变化现象。当施加的EEF不断增强,C1与C2间的内电场随着电子的局域转移而不断减弱,使R(1,2)的键长伸长,且EEF越大,R(1,2)的键长伸长的速度越快; 相应的,EEF与内电场的叠加使R(1,18), R(2,26), R(21,30), R(34,35)的内电场不断增强,键长也随之不断缩短; 在EEF(-0.005~0.0025a.u.)作用下,由于内电场与EEF有同样的方向,相互作用后R(13,14)键长缓慢缩短。相反,在EEF(0.0025~0.01a.u.)作用下,内电场与EEF方向不同,叠加后R(13,14)键长缓慢伸长,变化并不明显; 同理,在X方向上施加EEF对O20-H24,C26=O25及C13-C14的内电场几乎没有影响,因此R(20,24),R(25,26),R(13,14)的键长变化不明显。
2.2 不同EEF下能隙的变化
通过DFTY/ B3LYP/6-311G(d, p)方法,对HES进行优化后,接着计算HES的能量,同时施加EEF(-0.005~0.010a.u.),得到HES的最低空轨道()能量
,最高占据轨道(
)能量
,见表3。能隙的计算公式
:
(3)
由公式(3)得到的最终结果列于表3中。
图6是能隙随EEF的变化图,在X方向上施加负向EEF(由0增至0.005a.u.)和正向EEF(由0增至0.010a.u.),迅速减小,说明在正负向EEF都增大时,电子易发生跃迁,分子更易被激发,因此处于活跃的状态。
图6 不同EEF下能隙的变化
Fig. 6 Energy gapsunder different EEF
2.3 EEF对红外光谱的影响
选用DFTY/ B3LYP/6-311G(d, p)方法, 对HES分子优化并计算频率, 就能得到IRS。在无EEF作用下的IRS见图7(a), 频率为823主要属于C6-H8键的
; 1174
为苯环上C9-H15,
C12-H16,C13-C17,C6-H8的与酚羟基O19-H22的
; 1264
为酚羟基(O19-H22,O18-H23)的
与6C-8H的
; 1696
主要是C26=O25的
、苯环上C1=C6的
与O18-H23的
;甲基的
体现在3010
处;3325
属于O18与H23之间的
。在EEF(-0.005~0.010a.u.)作用下,分别得到对应的IRS,见图7,图7中的(a-g) 依次对应EEF为0a.u., -0.005a.u.,-0.0025a.u.,0.0
025a.u.,0.005a.u.,0.0075a.u.,0.001a.u.时的IRS。这里列出6个相对较强的谱峰,从左到右的谱峰依次用数字1至6来指明。
表1 基态总能量、偶极矩
随EEF
变化关系
Table 1 The relationship between the ground state total energy E/Hartree, dipole moment/Debye and external electric field F /a.u.
F |
-0.0050 |
-0.0025 |
0 |
0.0025 |
0.0050 |
0.0075 |
0.0100 |
E |
-1069.77278 |
-1069.76395 |
-1069.75754 |
-1069.75338 |
-1069.75139 |
-1069.75154 |
-1069.75387 |
μ |
10.9025 |
8.7344 |
6.9595 |
5.5973 |
4.8791 |
5.0495 |
6.0347 |
F |
R(1,2) |
R(1,18) |
R(2,26) |
R(13,14) |
R(20,24) |
R(21,30) |
R(25,26) |
R(34,35) |
-0.0050 |
1.4252 |
1.3412 |
1.4494 |
1.3937 |
0.9681 |
1.4299 |
1.2387 |
1.4682 |
-0.0025 |
1.4262 |
1.3386 |
1.4482 |
1.3926 |
0.9673 |
1.4256 |
1.2373 |
1.4554 |
0 |
1.4274 |
1.3362 |
1.4465 |
1.3918 |
0.9666 |
1.4222 |
1.2362 |
1.4470 |
0.0025 |
1.4289 |
1.3339 |
1.4445 |
1.3917 |
0.9660 |
1.4191 |
1.2354 |
1.4409 |
0.0050 |
1.4306 |
1.3317 |
1.4424 |
1.3919 |
0.9654 |
1.4161 |
1.2347 |
1.4360 |
0.0075 |
1.4324 |
1.3295 |
1.4400 |
1.3925 |
0.9649 |
1.4134 |
1.2342 |
1.4316 |
0.0100 |
1.4344 |
1.3274 |
1.4375 |
1.3935 |
0.9645 |
1.4112 |
1.2338 |
1.4277 |
表2 优化的HES分子键长R/Å 与F /a.u.的关系
Table 2 Optimized relationship between the molecular bond length R /Å and F /a.u. of HES
F /a.u. |
-0.0050 |
-0.0025 |
0 |
0.0025 |
0.0050 |
0.0075 |
0.0100 |
|
-0.07832 |
-0.06849 |
-0.05884 |
-0.04955 |
-0.04172 |
-0.04844 |
-0.07297 |
|
-0.19660 |
-0.20949 |
-0.22216 |
-0.21665 |
-0.20430 |
-0.19178 |
-0.17911 |
|
0.11828 |
0.14100 |
0.16332 |
0.1671 |
0.16258 |
0.14334 |
0.10614 |
|
3.21722 |
3.83520 |
4.44230 |
4.54512 |
4.42218 |
3.89885 |
2.887008 |
表3 不同EEF下HES,
,
Table 3 ,
and energy gap
of HES molecules under different EEF
&