橙皮素电场作用的分子结构和红外光谱精细分析

橙皮素电场作用的分子结构和红外光谱精细分析

王新强, 葛浩然, 李桂琴, 叶松, 汪杰君, 甘永莹, 王方原

 

摘 要 橙皮素(HES)是一种二氢黄酮药物,为研究在外电场(EEF)作用下,HES的分子结构和光谱的变化,本文利用密度泛函理论(DFTY)以及6-311G(d,p)基组,在外电场(-0.005~0.010a.u.)作用下优化HES分子的基态几何构型,研究了分子总能量、红外光谱( IRS)、偶极矩(DM)和能隙。在此基础上,采用含时密度泛函理论(TDDFT),研究不同EEF下对紫外可见吸收光谱(UV-Vis-S)、激发态(ES)的影响。结果显示,随着EEF的增强,分子总能量先升后降,DM则先降后增,键长和振子强度(OS)的变化复杂。正负EEF都增强时,能隙不断减小,IRS吸收峰(AP)和UV-Vis-S2个AP均出现了频谱移动 ,分子各个激发态能量(EE)呈现减小趋势。分析外电场下物质的分子结构和光谱,将为研究橙皮素的药效对其进行电场解离提供理论参考。

关键词: 橙皮素(HES); 外电场(EEF); 分子结构光谱


 

橙皮素(hesperetin, HES)是二氢黄酮中的一种关键性药物,具胃、利尿、抗动脉粥硬化调节心血管功能抗病毒保护视力保护神经系统以及提高其他药物生物利用度,广泛应用于医学的各个领域HES还是-淀粉酶抑制剂能有效的缓解糖尿病。另外HES还有抑制癌细胞的扩大转移以及抗肿瘤的作用近年来,人们主要研究了HES的抗氧化和抑制癌细胞的功效,例如探究HES抗氧化活性抵制致癌基因表达但是对橙皮素在外电场(external electric field, EEF)下的分子结构红外光谱(infrared pectroscopy, IRS)及紫外可见吸收光谱(UV-visible absorption spectrum,UV-Vis-S)研究很少有报道。EEF会对分子特性产生一定的影响,改变其电子光谱、分子取向甚至产生新的化学键研究EEFHES分子特性,可以为电场解离方法研究其抗氧化和抗菌抗癌的功效提供理论指导。本文首先选用密度泛函理论(density function theory, DFTY),分析了EEF作用下HES分子的键长偶极矩(dipole moment,DM)和IRS的吸收峰(absorption peak,AP)的蓝移(blue shift,BS)和红移(red shift,RS)。接着通过TDDFT

      

 

法进行仿真得到不同EEF下激发态(excited state,ES)的激发能(excitation energy,EE)和振子强度(oscillator strength,OS),1为其未优化的分子结构图。

       

1  未优化的HES分子结构图

Fig. 1  Unoptimized molecular structure of HES 

                                                                                                                                                                                                                                                                          1  理论和计算方法

考虑EEF的作用,分子体系由两块组成

               (1)

其中,是无EEF的哈密顿量,为EEF与分子体系的相互作用。考虑, EEF与分子体系的相互作用能为

 

                (2)

其中是分子电偶极矩, F为外电场。

本文利用软件,首先选用DFTY/ B3LYP/6-311G(d, p)方法,沿X轴方向施加EEF(-0.005~0.010a.u.)。着分析了不同EEF下HES分子的基态几何参数和IRS的改变情况。最后通过方法,在相同的基组下,仿真HES分子,得到9个单重ES的EE和OS,并分析其在不同EEF下的变化情况。

无EEF作用时对HES分子优化后的基态结构如图2所示。对比图1图2,可以发现图2中C1与O18间的单键、C2与C26间的单键都优化成了双键,转变为烯醇式结构,这样促使分子中更多的基团与苯环处于同一个平面,构成一个共轭体系,使分子能量降到最低,形成最稳定的结构。

 

 

图2  无EEF作用的HES分子优化结构图

Fig. 2  Optimized molecular structure of HES without EEF

 

2   结果与讨论

2.1 不同EEF下HES分子的几何结构

采用DFTY/B3LYP/6-311G(d, p)方法,在EEF(-0.005~0.010a.u.)作用下进行优化,得到HES的基态稳定结构的主要参数,见表1和表2。

从表1可以看出,在EEF作用下, HES的基态总能量在负向EEF(-0.005~0a.u.)下不断增大,而在正向EEF(0~0.005a.u.)上升(上升0.00615a.u.),在EEF(0.0050.01a.u.)下逐步衰减(衰减0.00248a.u.,斜率变小),如图3所示。DM的改变则恰恰相反,在EEF(-0.005~0a.u.)一直减小,而在正向EEF(0~0.01a.u.)先降低后升高,在F=0.005a.u., DM达到极小值为4.8791如图4所示。

2列出了部分键长在不同EEF下的大小,从图5可以看出,在EEF(-0.005~0.010a.u.)作用下, R(1,2)的键长不断伸,而R(1,18), R(2,26), R(21,30), R(34,35)的键长明显缩短; R(13,14)的键长在负向EEF(-0.0050~0a.u.)作用下缓慢缩短,而在正向EEF(0~0.01a.u.)下逐渐被拉长,变化并不强烈(标准差为0.00075Å);另外R(20,24), R(25,26)也有小幅缩短的现象,变化也不强烈(标准差分别为0.00121Å,0.00164Å)。

 

 

3  分子在EEF作用下的基态总能量变化

  Fig. 3  Ground state energy of HES under different EEF

 

 

   

4  分子在EEF作用下的偶极矩变化

        Fig. 4  Dipole moment of HES under different EEF

 

 

   

 

 

5  分子部分键长随EEF变化的关系

(a) R(1,2),R(2,26),R(1,18),R(34,35);

(b)R(13,14),R(21,30),R(20,24),R(25,26)

 Fig. 5  Partial results of several bond lengths under different EEF

(a)R(1,2),R(2,26),R(1,18),R(34,35); (b)R(13,14),R(21,30),R(20,24),R(25,26)

 

分子内电场与EEF的叠加作用,能定性的分析键长的变化现象。当施加的EEF不断增强,C1与C2间的内电场随着电子的局域转移而不断减弱,使R(1,2)的键长伸长,且EEF越大,R(1,2)的键长伸长的速度越快; 相应的,EEF与内电场的叠加使R(1,18), R(2,26), R(21,30), R(34,35)的内电场不断增强,键长也随之不断缩短; 在EEF-0.005~0.0025a.u.)作用下,由于内电场与EEF有同样的方向,相互作用后R(13,14)键长缓慢缩短。相反,在EEF(0.0025~0.01a.u.)作用下,内电场与EEF方向不同,叠加后R(13,14)键长缓慢伸长,变化并不明显; 同理,在X方向上施加EEF对O20-H24,C26=O25及C13-C14的内电场几乎没有影响,因此R(20,24),R(25,26),R(13,14)的键长变化不明显。

2.2 不同EEF下能隙的变化

通过DFTY/ B3LYP/6-311G(d, p)方法,对HES进行优化后,接着计算HES的能量,同时施加EEF(-0.005~0.010a.u.),得到HES的最低空轨道()能量,最高占据轨道()能量,见3。能隙的计算公式:

                  (3)

由公式(3)得到的最终结果列于表3中。  

6是能隙随EEF的变化图,在X方向上施加负向EEF(由0增至0.005a.u.)和正向EEF(由0增至0.010a.u.),迅速减小,说明在正负向EEF都增大时,电子易发生跃迁,分子更易被激发,因此处于活跃的状态。

 

 

6  不同EEF下能隙的变化

 Fig. 6    Energy gapsunder different EEF

2.3 EEF对红外光谱的影响

选用DFTY/ B3LYP/6-311G(d, p)方法, 对HES分子优化并计算频率, 就能得到IRS。在无EEF作用下的IRS见图7(a), 频率为823主要属于C6-H8键的; 1174为苯环上C9-H15,

C12-H16,C13-C17,C6-H8的与酚羟基O19-H22的; 1264为酚羟基(O19-H22,O18-H23)的6C-8H的; 1696主要是C26=O25的、苯环上C1=C6的与O18-H23的;甲基的体现在3010处;3325属于O18与H23之间的。在EEF(-0.005~0.010a.u.)作用下,分别得到对应的IRS,见图7,图7中的(a-g) 依次对应EEF0a.u., -0.005a.u.,-0.0025a.u.,0.0

025a.u.,0.005a.u.,0.0075a.u.,0.001a.u.时的IRS。这里列出6个相对较强的谱峰,从左到右的谱峰依次用数字1至6来指明。

 


表1   基态总能量、偶极矩随EEF变化关系

Table 1  The relationship between the ground state total energy E/Hartree, dipole moment/Debye and external electric field F /a.u.

F

-0.0050

-0.0025

0

0.0025

0.0050

0.0075

0.0100

E

-1069.77278

-1069.76395

-1069.75754

-1069.75338

-1069.75139

-1069.75154

-1069.75387

μ

10.9025

8.7344

6.9595

5.5973

4.8791

5.0495

6.0347

    


F

R(1,2)

R(1,18)

R(2,26)

R(13,14)

R(20,24)

R(21,30)

R(25,26)

R(34,35)

-0.0050

1.4252

1.3412

1.4494

1.3937

0.9681

1.4299

1.2387

1.4682

-0.0025

1.4262

1.3386

1.4482

1.3926

0.9673

1.4256

1.2373

1.4554

0

1.4274

1.3362

1.4465

1.3918

0.9666

1.4222

1.2362

1.4470

0.0025

1.4289

1.3339

1.4445

1.3917

0.9660

1.4191

1.2354

1.4409

0.0050

1.4306

1.3317

1.4424

1.3919

0.9654

1.4161

1.2347

1.4360

0.0075

1.4324

1.3295

1.4400

1.3925

0.9649

1.4134

1.2342

1.4316

0.0100

1.4344

1.3274

1.4375

1.3935

0.9645

1.4112

1.2338

1.4277


2 优化的HES分子键长RF /a.u.的关系

Table 2   Optimized relationship between the molecular bond length R /Å and F /a.u. of HES

 


F /a.u.

-0.0050

-0.0025

0

0.0025

0.0050

0.0075

0.0100

-0.07832

-0.06849

-0.05884

-0.04955

-0.04172

-0.04844

-0.07297

-0.19660

-0.20949

-0.22216

-0.21665

-0.20430

-0.19178

-0.17911

0.11828

0.14100

0.16332

0.1671

0.16258

0.14334

0.10614

3.21722

3.83520

4.44230

4.54512

4.42218

3.89885

2.887008


 

表3  不同EEF下HES,,

Table 3   , and energy gap of HES molecules under different EEF




                                               &

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