《日本学刊》（双月刊）创刊于1985年，是由中国社会科学院日本研究所主办的综合性和学术性期刊。1990年2月中华日本学会成立时决定改为学会会刊，并与中国社会科学院日本研究所联合主办，更名为《日本学刊》，于1991年1月出版发行。
《日本学刊》是以学术性为主，兼顾知识性，改为《日本学刊》后，进一步突出了其综合性和学术性，并强调它要为发展有中国特色的日本研究和建立中国的日本学发挥作用。《日本学刊》系全国中文核心期刊，2005年荣获中国社会科学院优秀期刊提名奖。主要刊登我国日本研究者关于日本诸学科的优秀研究成果，包括日本政治、经济、外交、军事、科技、社会文化、语言文学、历史、哲学等。